本所在研究發展上之特色為以臨床為導向，著重臨床藥學與藥事行政之理論與實務研究，包含臨床療效/安全性研究、藥品交互作用研究、病人服藥順從性研究、藥物使用評估研究、臨床藥品動態學、藥物經濟學、藥物流行病學、藥事行政管理學及社會行為學與藥物遺傳學等研究。旨揭指導本所學生進行及完成上述各課題之論文研究。